Решения налоговых органов о доначислении налогов, а также сумм соответствующих штрафных санкций и пени, в случае несогласия с ними налогоплательщиком должны сначала обжаловаться в вышестоящий налоговый орган и только потом, в случае неудовлетворения требований налогоплательщика, в суде (п.2 ст.138 НК РФ). Срок для подачи заявления в суд установлен как 3 месяца с момента, когда поступил отказ на обжалование от вышестоящего налогового органа (п.4 ст.198 АПК РФ).
Т.е. Налоговым кодексом РФ предусмотрено обязательное досудебное обжалование только в одном (первом) вышестоящем налоговом органе (например, в Управлении ФНС по субъекту РФ). В таком случае обжалование в иных более высокостоящих налоговых инстанциях (например, в центральном аппарате ФНС РФ) необязательно и можно сразу обращаться в суд. Более того, дальнейшее обращение в вышестоящие налоговые инстанции может привести к пропуску срока для подачи заявления в суд и лишить налогоплательщика судебной защиты, что подтвердил Арбитражного суда Московского округа в своем Постановлении от 14.07.2025 № Ф05-10008/2025 по делу № А41-63940/2024.
Таким образом, в случае наличия разногласий с налоговиками не стоит пытаться искать правду в кулуарах ФНС РФ, а при получении первого отказа следует сразу обращаться в суд.
